对纯化蛋白进行质谱分析 下面，我们用“古老”的蛋白质组学研究方法——2维凝胶电泳法（two-dimensionlgeleletrophoresis,2DE）结合质谱分析法对纯化蛋白进行质谱分析的策略为例进行介绍（图2）。待测目标蛋白经消化酶解之后经由质谱仪进行鉴定，通常使用的都是MLDI-ToF质谱仪来获取肽链指纹图谱（peptidemssfingerprint）。近，出现了好几种该策略的改进方法，即将各种连续电泳分离方法（sequentileletrophoretiseprtionmethod）或色谱分离方法（hromtogrphiseprtionmethod）结合进来，以提高质谱检测时的峰容量，这样就提高了对复杂样品的分辨率。定量分析则是在蛋白质水平通过比较不同样品中目标蛋白的信号强度来完成的。