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重杆质谱仪在MRM模式下也能以极高的敏感度进行定量分析。已知的或未知的分析物都以极高的敏感度和选择性能被定量检测出来。这种高选择性得益于质谱仪能够对代表个肽段的对离和片段裂解物离子进行实时监测。而且,在MRM模式下进行的两轮选择过程会极大地提高检测的灵敏度,因为轮筛选过后只能剩下很少的离子,这也就将背景噪声减小到了低水平。碰撞诱导解离片段离子(ollision-indueddissoitionfrgmentions,ID)来源于离,这些ID离子能够产生离散信号,而背景化学噪声信号则是随机分布的。后,由于这种采样时间很长的技术固有的非扫描本质使得它的敏感度非常高,相比离子扫描技术的探测极限(LOD)要高出好几个数量级。

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